Nos solutions

• : Isolation de matériel génétique de haute qualité à partir de vos échantillons (cellules, tissus, bactéries, prélèvements environnementaux tels que fécès, eau, sol…). Une extraction optimisée est la première étape cruciale garantissant le succès des analyses ultérieures.

Amplification génétique pour répondre à de nombreuses problématiques. La PCR conventionnellepermet de détecter la présence d’une séquence cible (qualitativement), tandis que la PCR quantitative (qPCR/RT-qPCR) offre une quantification en temps réel. Ces techniques sont utilisées par exemple pour détecter un gène ou un organisme en très faible quantité, pour mesurer l’expression relative d’un gène ou pour identifier une mutation précise dans l’ADN.

Cette technique d'amplification génique permet de détecter un gène ou indirectement un organisme présent en très faible quantité dans un échantillon, de mesurer l'expression d'un gène ou encore d'identifier une mutation dans l'ADN.

Service de séquençage traditionnel par électrophorèse capillaire, idéal pour lire des fragments d’ADN jusqu’à ~800 pb ou pour confirmer la séquence d’un gène. Nous offrons un service rapide (résultats en 48h après réception) avec une qualité de lecture optimale, assuré par des experts diplômés dans cette technique.

Conception et optimisation de librairies prêtes à être séquencées sur plateformes haut débit. Nous prenons en charge la purification et la sélection de fragments (par exemple avec PippinHT) afin d’obtenir des librairies d’ADN/ARN de taille adaptée, qu’il s’agisse de longues insertions pour du long read sequencing ou de fragments adaptés aux séquenceurs short read. 

Séquençage à haut débit sur nos plateformes Illumina (MiSeq, iSeq 100). Nous réalisons divers types de projets NGS : séquençage d’amplicons (ex : 16S/ITS pour métabarcoding, panels de gènes), séquençage de plasmides ou de petits génomes complets (génomes bactériens par exemple), RNA-seq pour l’analyse globale de l’expression des gènes, séquençage d’exomes (WES) pour l’étude ciblée des régions codantes du génome, ou encore métagénomique shotgun (séquençage aléatoire d’ADN environnemental pour profiler un microbiome). Selon les besoins, nous pouvons également intégrer des approches particulières comme le séquençage de l’ADN méthylé (methyl-seq) pour des études épigénétiques, ou le séquençage après immunoprécipitation de chromatine (ChIP-seq) pour explorer les interactions ADN-protéines. Nos spécialistes en bio-informatique traitent ensuite ces données massives via des pipelines d’analyse dédiés, incluant étapes de mapping des lectures sur des génomes de référence, d’assemblage lorsqu’aucun génome de référence n’est disponible, d’annotation et d’interprétation biologique des résultats. 

Une offre spécifique pour conserver la trace génétique d’anticorps monoclonaux ou polyclonaux (par exemple dans le cadre de la production d’anticorps thérapeutiques ou de diagnostics). Nous séquençons les régions codantes des chaînes légères et lourdes afin de sauvegarder la séquence de l’anticorps d’intérêt, ce qui permet de sécuriser la lignée cellulaire productrice et de faciliter d’éventuelles reproductions ou modifications ultérieures. 

Typage de séquences répétées courtes (STR) dans le génome, technique particulièrement utile pour les tests de filiation/apparentement, l’identification génétique d’individus (p. ex. contrôle de parenté, authenticité de souches) ou le suivi de populations en génétique de la conservation. Nos analyses de microsatellites fournissent des profils génétiques fiables pour comparer des individus entre eux ou suivre l’évolution d’une population dans le temps. 

Outre ces solutions phares, nos chefs de projet peuvent mobiliser de nombreuses autres techniques de biologie moléculaire en fonction de vos besoins. Par exemple, nous pouvons créer des vecteurs de clonage sur mesure, exprimer et purifier des protéines recombinantes, réaliser des dosages immunologiques (types ELISA, western blot, etc.) ou mettre en place des essais de culture cellulaire avec analyses associées. N’hésitez pas à nous consulter pour toute demande spécifique : si une technique existe en biologie moléculaire, nous avons soit la capacité de la réaliser en interne, soit l’expertise pour la développer en collaboration afin de répondre à votre problématique. (En savoir plus…)