Vos questions portent sur l’expression génétique ou la quantification d’acides nucléiques ? Biomnigene dispose de solutions pour étudier l’expression des gènes au niveau de l’ARN messager (ARNm) comme au niveau de l’ADN génomique, en utilisant des approches de transcriptomique et de PCR quantitative.
Pour une analyse globale de l’expression, nous proposons le RNA-seq (séquençage à haut débit de l’ARN). Cette technique de transcriptomique permet d’obtenir le profil d’expression complet des gènes d’un organisme ou d’un tissu donné. Nos experts réalisent l’étude du transcriptome en comparant éventuellement plusieurs conditions (par exemple un échantillon traité vs non traité) afin d’identifier les gènes différentiellement exprimés (expression différentielle). L’analyse bio-informatique qui suit inclut la quantification précise de chaque transcript, l’identification des gènes en sur-expression ou sous-expression, et l’interprétation fonctionnelle des résultats. Nous utilisons pour cela des analyses de type Gene Ontology et voies de signalisation (voies métaboliques, cartes KEGG) afin de comprendre quelles fonctions biologiques ou quels pathways sont impactés par la condition étudiée. Vous saurez ainsi quels gènes sont régulés à la hausse ou à la baisse et quelles grandes fonctions cellulaires sont concernées par ces variations d’expression.
Pour des besoins de quantification absolue ou ciblée, Biomnigene propose des méthodes basées sur la PCR. Notre service de qPCR (PCR quantitative en temps réel) permet de quantifier l’expression d’un gène spécifique de manière sensible et rapide, ou de détecter la présence d’un gène (ou micro-organisme) même en très faible quantité dans un échantillon. Nous effectuons également des analyses par PCR digitale (ddPCR), une technologie ultra-sensible qui partitionne l’échantillon en de très nombreuses gouttelettes ou micro-réactions. La PCR digitale est particulièrement indiquée pour la détection d’événements rares (par ex. un mutant rare dans une population de cellules) ou la quantification absolue sans avoir besoin de courbe étalon, ce qui la rend idéale pour mesurer avec exactitude des charges virales, des copies de gènes ou des CNV. En combinant ces approches, nous pouvons à la fois mesurer des variations relatives d’expression (par qPCR ou RNA-seq, pour connaître le facteur de changement d’un gène entre deux conditions) et obtenir des quantifications absolues en copies par cellule ou par volume (via PCR digitale), fournissant une vision complète de la régulation génique.
Enfin, Biomnigene peut examiner l’effet de molécules actives ou de facteurs externes sur l’expression des gènes. Par exemple, nous pouvons comparer l’expression de panels de gènes d’intérêt avant et après un traitement (médicament, stress environnemental, etc.) afin d’évaluer la réponse moléculaire induite. Ces études d’expression intègrent souvent des analyses statistiques rigoureuses pour confirmer la significativité des changements observés et mettre en lumière les biomarqueurs les plus pertinents.
